Van het platteland van België komt een ondoorgrondelijk verhaal over een naamloze boer, zijn zeug, en hun grenzeloze liefde. Wanneer hij verschillende dubieuze substanties uitprobeert op zijn zeugen, lijkt de laatste man op aarde als in een Jungiaanse analogie een onbewuste poging tot transmutatie te ondernemen. 

Tijdens een tussenstop bij een benzinestation op weg naar Frankrijk verliest Rex Saskia, die de laatste tijd gekweld werd door een terugkerende droom, uit het oog. Saskia verdwijnt spoorloos, waardoor Rex in een maalstroom van speculaties terechtkomt en uiteindelijk in een zorgvuldig door Saskia’s ontvoerder geweven spinnenweb belandt. 

Photon is een bizar geïllustreerd betoog dat laveert tussen de oerknal, de kwantumrevolutie, de oorsprong van tijd en de toekomstige evolutie van biologisch leven. De film, die de stream of consciousness van een narcistische deeltjesfysicus volgt, is een hypnotische seance die harde wetenschap terugbrengt tot herkenbare metaforen en alledaagse gebeurtenissen.

Wie is Jack McCann? Een wanhopige goudzoeker? Een hebzuchtige plutocraat? Een overheersende vader? Een mysterieuze alchemist? In verschillende stadia en tijdperken is McCann steeds een ander figuur, en als hij een bron van goud vindt begint zijn zoektocht naar onsterfelijkheid.